Regroupement des étudiants chercheurs en pharmacologie
de l'Université de Sherbrooke

Les possibilités avec Graphpad sont très intéressantes et très variées, Graphpad est un logiciel de calcul qui se veut un incontournable dans l’analyse de vos données et il surpasse Excel dans bien des domaines tout en étant beaucoup plus convivial.

Obtenir Graphpad Prism 5.0

Nicole Gallo-Payet, vice-doyenne à la recherche de la FMSS, a acheté le logiciel Graphpad Prism 5.0 pour tout l’université.

Il est possible de le télécharger gratuitement sur le site officiel du logiciel. Pour obtenir votre version gratuite et complète, vous devez remplir le formulaire avec les informations suivantes :

votre adresse courriel Usherbrooke,
votre département : Pharmacologie
votre adresse : vous pouvez utiliser celle de la FMSS soit 3001 12e avec Nord Sherbrooke, Qc, Canada, J1H 5N4
statut : étudiant

La compagnie va ensuite vous permettre de télécharger le programme et va vous envoyez une clé d’enregistrement pour le valider.

Utiliser Graphpad Prism 5.0

Vous pouvez utiliser Graphpad pour vérifier si vos résultats sont significatifs en effectuant différents tests statistiques, vous pouvez construire vos histogrammes, vos courbes doses-réponses, calculer des Kd, etc. Bref, allez télécharger Graphpad et profitez de tout ce que le programme peut vous offrir ! Voici un petit tutoriel pour une fonction très utile de Graphpad : la construction d’une courbe dose-réponse.

Construction d’une courbe dose-réponse

GraphPad Prism est totalement approprié pour construire simplement une belle courbe dose-réponse et ensuite permettre l’obtention de valeurs sur l’EC50 et d’autres paramètres utiles à l’analyse.

Tout d’abord, suite à l’ouverture de GraphPad (Fig. 1), vous aurez le choix entre plusieurs types de graphiques. Pour le moment choisissez "points only" à la gauche dans la liste de choix. Ensuite vous pouvez cocher, pour les informations sur le Y, "Enter X replicates values" Vous indiquerez à ce moment combien de réplicats vous voulez entrer dans le graphique pour chaque dose. Je vous conseille dans ajouter quelques uns de plus que ce que vous anticiper utiliser par précaution. Ensuite il est important de choisir si vous voulez voir graphiquement la moyenne, la moyenne et l’écart type (SD) ou les données individuelles.

Fig. 1 Ouverture de GraphPad

Par la suite, un tableur de style Excel apparaitra à l’écran. Vous pouvez inscrire en X les noms des différentes courbes et en Y les doses utilisées. (Fig. 2) Ensuite, vous pourrez entrer les différentes valeurs de Y pour chaque dose de drogue. Notez que bien souvent l’utilisation d’Excel est nécessaire pour préalablement calculer vos données. Vous pourrez ensuite allez cliquer dans l’onglet "Graph" dans la barre de gauche pour voir la première version de vos courbes (Fig. 3).

Fig. 2 Tableur

Fig. 3 Premier graphique

Par la suite, vous voudrez bien sûr que votre graphique ressemble à une courbe dose réponse ! Vous pouvez nommer vos axes, changez les échelles ; pour mettre l’échelle de doses en log vous n’avez qu’à double-cliquer sur celle-ci et choisir dans l’option "scale" Log 10. Vous pouvez aussi différencier vos courbes en ajoutant de la couleur, bref arranger la structure du graphique pour que vous l’aimiez et qu’il soit professionnel (Fig. 4). Ensuite, il est venu le temps d’ajouter la courbe ! Cliquez, dans la barre d’outils du haut sur l’icône courbe dans la section "Analysis" Choisissez la section "Dose-Response - Stimulation" et choisissez log (agonist) - response et cliquez sur OK, vous devriez avoir maintenant votre courbe dose-réponse (Fig. 5).

Fig.4 Graphique amélioré

Fig. 5 Courbe dose-réponse

Dans l’onglet "Results" il est aussi possible de voir les paramètres mathématiques de votre courbe comme l’EC50.

Vous devriez maintenant avoir une "Belle" courbe dose-réponse tout dépendant de vos résultats !