Regroupement des étudiants chercheurs en pharmacologie
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>>Recherche de littérature avec GoPubMed

27 janvier 2008
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Quel est le bon mot ?

Il arrive fréquemment qu’il soit nécessaire de chercher plusieurs synonymes afin de trouver exactement ce que l’on veut sur PubMed ou autres outils de recherche scientifiques. Même que, bien souvent, on ne trouve pas tous les termes de recherche nécessaires pour faire une revue de la littérature exhaustive traitant du sujet voulu. Pour pallier ce problème, dans le domaine de la génétique, le projet Gene Ontology (GO) a été développé dans le but d’associer différents concepts à des mots clés et ainsi faciliter grandement la recherche de la littérature scientifique. De plus, ces mêmes mots clés sont aussi reliés entre eux et facilitent ainsi la recherche de concepts associés. Le projet GoPubMed se base sur ce principe en utilisant comme base de données celle de PubMed.

Des exemples de recherche avec GoPubMed

À titre d’exemple, si l’on recherche le terme angiotensin sur GoPubMed, on peut voir que la requête nous retourne plusieurs informations utiles comme le montre la Figure 1. D’abord, à droite, on peut voir les résultats de la recherche tel que PubMed le fait. À gauche, on peut apercevoir plusieurs thèmes associés à notre recherche. Si l’on clique sur l’un de ces thèmes, seuls les articles de cette catégorie seront affichés dans la colonne de droite afin de raffiner la recherche. Aussi, par exemple, il est possible de préciser la recherche selon le lieu géographique comme le montre la Figure 2. À droite, GoPubMed indique qu’à Sherbrooke, Gaétan Guillemette est l’auteur qui a le plus grand nombre d’articles concernant le terme « angiotensin » alors que tous les articles publiés à Sherbrooke concernant la requête sont également affichés.

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Figure 1

Recherche du terme « angiotensin ».

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Figure 2

Sélection des articles publiés à Sherbrooke.

De plus, GoPubMed peut également être très pratique pour obtenir de l’information sur un département ou sur un laboratoire. Par exemple, la Figure 3 montre le résultat d’une recherche concernant le Département de Pharmacologie de l’Université de Sherbrooke. À gauche, il est possible de voir quels sont les thèmes de recherche associés à ce département. À droite, il est possible de voir que Pierre Sirois est l’auteur qui possède à ce jour le plus de publications associées à ce département. Sur la Figure 4, il est possible de voir, à gauche, quels sont les auteurs principaux associés à ce département ainsi que le nombre d’articles publiés par année.
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Figure 3

Thèmes de recherche associés au Département de Pharmacologie.

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Figure 4

Auteurs associés au département et statistiques par année.

En conclusion

En somme, GoPubMed est un outil de recherche qui, en plus de retourner exactement les mêmes résultats que PubMed lors d’une recherche, classe vos résultats avec des expressions clés qui permettent ensuite de raffiner ou étendre notre recherche.

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