Qu’est-ce que le CEVDM?

Le Centre d’étude et de valorisation de la diversité microbienne s’intéresse aux microorganismes saprophytes d’importance économique, les actinomycètes, ainsi que les agents pathogènes ayant une importance en clinique humaine et vétérinaire, et en agro-alimentaire.  Les membres du CEVDM partagent une vision de la science qui allie une recherche fondamentale compétitive à une recherche appliquée menant au transfert technologique. 

Les chercheuses et chercheurs y développent des agents de lutte biologique en agriculture, des agents de régénération des sols contaminés (bioremédiation), des enzymes d’utilité commerciale, des antibiotiques et des vaccins.  On y étudie aussi l’épidémiologie des infections humaines et animales et les relations hôte-pathogène.  On utilise les produits de la diversité microbienne pour combattre les infections; C’est le yin et le yang!

Où sommes-nous?

Principalement localisés au nouveau pavillon ultramoderne des sciences de la Vie sur le campus principal de l’Université de Sherbrooke, les membres ont aussi des activités de recherche à la Faculté de Médecine (campus de la santé) et au Centre de recherche et développement des bovins laitiers et du porc à Agriculture et Agroalimentaire Canada (Lennoxville).

Enfin, les activités scientifiques des membres du CEVDM rayonnent à la grandeur du Canada avec leurs implications dans une variété de réseaux de recherche, notamment le Centre de recherche en amélioration végétale (SÈVE) de l’Université de Sherbrooke, le Centre d'étude de la forêt (CEF), le Regroupement pour la surveillance de la campylobactériose humaine (CAMPYLOSIS), le Centre de recherche en infectiologie et le Centre de recherche en pneumologie du Centre de recherche clinique (CRC) Étienne-Le Bel au Centre hospitalier de l’Université de Sherbrooke (CHUS), le Réseau canadien de recherche sur la mammite bovine (RCRMB) et le Centre de recherche en infectiologie porcine (CRIP) de l’Université de Montréal et aussi le Centre de recherche et d’étude sur la structure, la fonction et l’ingénierie des protéines (CREFSIP) de l’Université Laval.

Études de 2^ième et 3^ième cycles

Les recherches effectuées au centre offrent aux étudiantes et étudiants de 2e et 3e cycles une vaste gamme de projets qui impliquent la biochimie, l'écologie et la diversité microbienne, les interactions plantes-microorganismes (phytopathologie, symbiose), la pathogenèse, l'immunologie, la biologie moléculaire, le génie génétique et la biotechnologie.  Ce groupe pluridisciplinaire est de plus très intégré, de sorte qu'une étudiante ou un étudiant est régulièrement en contact avec les chercheuses et chercheurs et tous les membres de leur personnel.  Ces conditions créent un environnement particulièrement dynamique, propice à la recherche et au développement de l'esprit et de la méthode scientifique.

Les membres du CEVDM et leurs recherches

Par ordre alphabétique…

Nathalie Beaudoin (nathalie.beaudoin@usherbrooke.ca).
Professeure agrégée et membre associé au CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences. Elle s’intéresse à caractériser les mécanismes de résistance à la thaxtomine A, une phytotoxine produite par Streptomyces scabiei, l’agent responsable de la gale commune de la pomme de terre. En utilisant un modèle avec Arabidopsis thaliana, elle vise la production de cellules végétales résistantes à la thaxtomine A.

Carole Beaulieu (carole.beaulieu@usherbrooke.ca).
Professeure titulaire et membre associé au CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences. Directrice du Centre SÈVE, elle s’intéresse à la phytopathologie, c’est-à-dire aux pathogènes causant des maladies chez les plantes. Elle développe des agents de lutte biologique pour la protection des cultures contre les phytopathogènes et pour réduire l’utilisation des pesticides de synthèse.
 

Kamal Bouarab (kamal.bouarab@usherbrooke.ca).
Professeur adjoint et membre associé au CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences. Il s’intéresse aux mécanismes moléculaires qui contrôlent l’immunité de la plante ainsi qu’aux stratégies utilisées par certains pathogènes pour supprimer cette immunité et envahir leur hôte. Plusieurs métabolites secondaires élaborés par les plantes constituent une source de produits ayant des activités biologiques et antimicrobiennes sur les pathogènes humains.
 

Ryszard Brzezinski (ryszard.brzezinski@usherbrooke.ca). 
Professeur titulaire et membre régulier du CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Ses projets s'inscrivent dans le vaste domaine de la microbiologie moléculaire, avec des éléments d'écologie microbienne, enzymologie, chimie physique, génie biotechnologique et bioinformatique.  Il exploite la diversité du monde microbien par sélection et étude moléculaire pour des objectifs biotechnologiques concrets.  Ses projets en cours incluent l’isolement et l’étude des rapports structure-fonction de nouvelles chitosanases thermostables, l’étude de la régulation transcriptionnelle de gènes de chitosanases; l’étude des biofilms (microorganismes producteurs et antagonistes) et le développement de systèmes de biofiltration pour l'air contaminé par l'ammoniac et le méthane.

Vincent Burrus (vincent.burrus@usherbrooke.ca). 
Professeur adjoint et membre régulier du CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Il s’intéresse aux mécanismes qui facilitent les échanges de gènes entre bactéries pathogènes et aux conséquences de ces échanges sur l’évolution, la physiologie et la virulence des bactéries. Ses modèles principaux sont Vibrio cholerae, l’agent causal du choléra, et d’autres microorganismes responsables de diarrhées infectieuses.  Au niveau moléculaire, il étudie les mécanismes d’initiation et de terminaison du transfert conjugatif et de mobilisation d’îlots génomiques, et les mécanismes de recombinaison impliqués dans les échanges de gènes résistance aux antibiotiques et dans l’acquisition de facteurs de virulence.

Louis-Charles Fortier
(Louis-Charles.Fortier@usherbrooke.ca). 
Professeur adjoint et membre régulier du CEVDM, Département de microbiologie et infectiologie, Faculté de médecine. Il s’intéresse aux bactériophages et leurs enzymes (ex : les endolysines), de même qu’aux bactéries pathogènes, plus particulièrement le Clostridium difficile. Les études en cours portent sur la diversité des bactériophages et le rôle que ceux-ci jouent dans la biologie et l’évolution de C. difficile, de même que sur leur potentiel thérapeutique (phagothérapie). Il s’intéresse également aux mécanismes de virulence et de sporulation chez C. difficile.

Eric Frost (eric.frost@usherbrooke.ca). 
Professeur associé et membre associé au CEVDM, Département de microbiologie et infectiologie, Faculté de médecine.  Il s’intéresse aux méthodes moléculaires pour le diagnostic des maladies infectieuses, la détection des gènes de résistance aux antibiotiques et à l’épidémiologie des infections bactériennes et virales.  Il est impliqué dans plusieurs projets touchant le Clostridium difficile, le Campylobacter, le Chlamydia trachomatis, le Cryptosporidium, le Giardia, le HSV et VIH.

Pierre Lacasse (lacassep@agr.gc.ca).  
Professeur associé et membre associé au CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Localisé au Centre de recherche et de développement sur le bovin laitier et le porc d’Agriculture et agroalimentaire Canada à Sherbrooke et expert de la biologie de la lactation chez la vache. Il s’intéresse au problème des infections de la glande mammaire dans l’industrie laitière et aux conséquences des niveaux de production très élevés des vaches d’aujourd’hui sur la santé des animaux.  Il développe des vaccins pour la prévention des infections chez la vache.

François Malouin (francois.malouin@usherbrooke.ca). 
Professeur titulaire et directeur du CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Ses projets visent à comprendre la pathogenèse du SARM (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline) responsable d’infections nosocomiales mortelles et d’Escherichia coli O157:H7 retrouvé chez les bovins de boucherie et responsable de la « maladie du hamburger » et du syndrome hémolytique et urémique (SHU) ayant causé plusieurs décès ces dernières années.  Il utilise la technologie des puces à ADN pour ses études de génomique et transcriptomique en vue d’identifier de nouvelles cibles bactériennes pour le développement de vaccins et d’antibiotiques.  Il étudie le mode d’action des antibiotiques et fait aussi l’évaluation pré-clinique de nouvelles molécules synthétiques ou naturelles isolées des plantes.

Sophie Michaud (sophie.michaud@usherbrooke.ca). 
Professeure agrégée et membre régulier du CEVDM, Département de microbiologie et infectiologie, Faculté de médecine.  Son programme de recherche est axé sur la prévention des infections nosocomiales et acquises en communauté. Les thèmes principaux sont les maladies entériques et la transmission des infections par l’eau.  En combinant des méthodes d'épidémiologie clinique, moléculaire et géomatique, elle vise à développer de nouvelles approches de surveillance, de prévention et de contrôle d'infections ayant un impact majeur en santé publique.  Ses thèmes de recherche principaux incluent les entérites à Campylobacter et les colites à Clostridium difficile.

Sébastien Roy (sebastien.roy@usherbrooke.ca). 
Professeur adjoint et membre régulier du CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Il étudie l'actinobactérie Frankia, laquelle fixe l'azote atmosphérique et la livre aux plantes avec lesquelles elle forme une symbiose racinaire (e.g. aulnes).  Il s’intéresse à Frankia et les aulnes dans les environnements contaminés, investiguant à la fois l'impact de l'activité industrielle sur ces organismes, puis leur potentiel pour la revégétalisation des écosystèmes perturbés. Il développe présentement des méthodes avancées pour la culture de Frankia et l’étude de son protéome basées sur l'utilisation de bioréacteurs. L'étude de l'impact du stress anthropogénique sur cette bactérie porte spécifiquement sur les métaux lourds, les hydrocarbures, la salinité et l'alcalinité.

Brian Talbot (brian.talbot@usherbrooke.ca). 
 Professeur titulaire et membre régulier du CEVDM, Département de biologie, Faculté des sciences.  Ses études se concentrent sur le développement d'un vaccin contre les maladies provoquées par l’infection avec Staphylococcus aureus.  Cette bactérie cause plusieurs infections chez les humains (infections de la peau, infections postopératoires, ostéomyélite, arthrite septique, endocardite) mais aussi la mammite bovine qui est un problème économique important pour l'industrie laitière.  Ces travaux concernent les transporteurs moléculaires d'ADN et la réponse immunitaire contre des vaccins à ADN.

Thèmes et axes de recherche

La recherche effectuée au CEVDM est organisée en quatre Thèmes où œuvrent et collaborent nos membres: Thème I, base moléculaire de la résistance aux antibiotiques et de la pathogenèse; Thème II, découverte d’alternatives aux antibiotiques; Thème III, étude de la diversité microbienne (enzymes et omiques); Thème IV, microbiologie environnementale.  Ces recherches contribuent à une variété de développements biotechnologiques et d’applications industrielles et environnementales et visent aussi le contrôle des infections humaines, animales et végétales.

Comment nous rejoindre?

Vous pouvez consultez le site Internet du Département de biologie de la Faculté des sciences de l’Université de Sherbrooke (http://www.usherbrooke.ca/biologie/), les membres du CEVDM par leur adresse courriel ou encore contactez :

Professeur François Malouin, MSc, PhD

Directeur, CEVDM

Université de Sherbrooke

Département de biologie, Faculté des sciences,

2500 boul. Université,

Sherbrooke, QC, Canada J1K 2R1

Francois.Malouin@usherbrooke.ca